Sau khi đánh bại Retak'ka, Boboiboy tìm được 1 chiếc hộp bí ẩn rơi ở gần nhà mình. Khi vừa chạm vào chiếc hộp, nó đã hút nguyên tố của cậu vào trong!? Chiếc hộp đó có liên quan gì tới Retak'ka không? Liệu Boboiboy có cứu được các nguyên tố của mình không? Và còn sự xuất hiện của ai đó nữa...